为科学评价科室运营效益，挖掘科室发展潜力，提高资源配置效益以及运营管理水平，准确核算科室成本已成为医院运营管理的必然要求。本文以某市属三级集团化公立医院的科室成本核算为例，分析了科室成本核算问题，并从健全组织架构、规范基础数据、统一成本归集口径、完善成本分摊政策、多维报表展示等方面进行了相关的实践与探索，以期为集团化医院的一体化、规范化、精细化科室成本核算提供参考。