目的：分析某三甲医院消化系统恶性肿瘤患者的住院费用结构及影响因素，为医院降低平均住院费用、精准合理控制治疗成本、减轻患者医疗经济负担提供建设性意见。方法：收集2019年-2023年出院病案首页主诊断ICD-10编码为（C15-C26）的患者信息，进行回顾性分析，并应用多元线性回归进行分析。结果：2022年平均住院总费用最高，2021年平均住院总费用最低。在收集的3 459例病案中，肝和肝内胆管恶性肿瘤患者1 446例，占比41.8%，其平均住院费用38 902.43元，平均住院天数18天。住院总费用中，药费和耗材费用占比最高。并发症/合并症、年龄、住院天数、是否手术、是否危重、手术级别等变量对住院总费用存在统计学意义（P < 0.05）。结论：药费和耗材费用对住院总费用有直接影响，应加强对药费和耗材的使用监管，规范医疗行为，提高医疗服务效率，进而有效降低消化系统恶性肿瘤患者的经济负担。