目的：分析南京市某社区医院在资源配置和运营管理中的效率问题，提出优化方案以提高医院整体运行效率。方法：基于医院实际运营数据，构建离散事件仿真（DES）模型模拟医院动态流程，评估资源配置影响，运用两阶段SBM-DEA模型对仿真方案进行效率评价与优化。结果：测试27种资源配置方案，结果表明有6种配置方案被评估为DEA有效，可以根据具体需求为社区医院提供不同的改进方向，包括优化各种资源配置、患者等待时间、排队长度和接待患者的数量，从而提升整体效率。结论：所提出的综合方案为社区医院提供了一种高效的资源配置评估工具，有助于发现运营瓶颈。当前社区医院的资源配置和运行效率需要提升，建议根据有效的配置方案结合实际需求进行调整，提升医院整体绩效。